CLSICO公司管理架构通过以下几大职能部门共同组成:
船队部：负责船队日常管理，保证船舶安全可靠高效地运营。
船员部: 负责所有船员的雇佣、调度和人力资源管理，并与第三方船员配员公司良好协作。
安全及质量管理部: 负责管理CLSICO的安全管理体系（SMS）；协调所有内部和外部审计，为舰队提供海上支援，以及向总经理提供关于所有安全政策和业绩事宜的独立意见。
财务部: 负责所有财务、内控和商务职能，包括代表船东安排船壳船机险，保赔险等保险事宜。
其他的重要职能部门由指定的个人负责，如岸上指定人（DPA）, 公司安全官(CSO).